מתחם שערי העיר מגידו הקדומה נמצא בצד הצפוני של התל. כפי ששמו מרמז, זהו המכלול הארכיאולוגי הראשון שפוגשים המבקרים באתר כיום, בדומה לאלו שבאו בשערי העיר בתקופת הברונזה וניצבו אז בפני ביצוריה המרשימים, עת הייתה מגידו מדינה כנענית. בשנת 1966 הוכרז תל מגידו גן לאומי ובשנת 2005 אתר מורשת עולם "התלים המקראיים" — תל מגידו, תל חצור ותל באר־שבע. בהכרזה זו נוסחו, בין היתר, ערכיו התרבותיים של מתחם השערים במגידו וחשיבותו ברצף הביקור באתר. 

 

בשנים 2006—2007 נערך תכנון ראשוני למתחם בידי האדריכל דניאל אבוחצירה. התכנון המפורט וביצוע עבודות השימור והשיקום הופקדו בידי מינהל שימור ברשות העתיקות (2018—2020). התכנון הציב לא מעט אתגרים ודילמות שמקורן ברצון לשמר את ערכיו של אתר רב־שכבתי זה ולהציג אותם למבקרים באופן מיטבי.